【机构建设】东莞市人民政府经济协作办公室是直属东莞市人民政府管理、归口市府办的副处级事业单位，2003年3月28日，经东莞市机构编制委员会同意内设对口帮扶科（东莞市扶贫工作领导小组办公室设在市政府经协办）。

　　【促进大京九协作】东莞市是大京九经济协作带的常任副主席方，市政府经协办作为具体协作部门，积极配合大京九经济协作带联络处开展工作。2003年，为加强东莞市与京九沿线各市的教育和文化交流，市政府经协办会同市教育局积极响应“百名博士京九行”活动，把常平中学作为“百名博士进百校”活动的试点学校；为办好第三届大京九农副产品食品（常平）交易会，市政府经协办专门协同大京九经济协作带联络处在河南商丘召开大京九协作带联络工作会议，在京九沿线城市中为东莞市的第三届大京九农副产品食品（常平）交易会的招商工作做宣传，向大京九沿线同行发出邀请书，同时，还邀请东莞市对口帮扶的河池市及韶关市组团参加，为河池市及韶关市争取免费展位7个，接待了来自国家发改委的领导和京九沿线的7省14个地级市的代表团成员。

　　【对口帮扶广西河池】东莞市采取支援资金、捐建希望学校、劳务输入和经贸合作等切实有效措施，促使河池市加快脱贫致富步伐，社会经济面貌发生了深刻变化。2003年，东莞市捐赠河池市的资金和物资达1418.6万元，其中市财政无偿援助580万元；援建希望学校19所,投入资金629万元；培训干部104名；落实经贸合作项目2个，到位资金2700万元；接收劳工27920人；两地党政部门互访38批792人次；派出支教教师16名；10月，两地开展“百企合作”活动，积极探讨扶贫工作从单纯政府支援向企业合作发展的新模式，取得较大成果。

　　【省内帮扶】东莞市积极做好对韶关市乳源县、新丰县的帮扶工作，重点放在落实帮扶资金、促进经贸合作和推动部门帮扶等方面。2003年，援助乳源、新丰两县资金共2000万元，超额1倍完成省下达任务；促成经贸投资项目2个，投资额6.53亿元，正在实施；援建希望学校12所；接收劳务输入2728人；接待乳源县、新丰县来访客人8批共60多人次。

　　【支援西藏和新疆】2003年，东莞市无偿援助新疆哈密市、西藏墨脱县的挂职干部工作经费及其它资金合计167万元，其中援助西藏67万元，援助新疆100万元，为当地政府和群众解决了一些实际困难。

　　【完善驻莞机构管理】  2003年4月，市政府经协办深入到全市26个外省市驻莞机构进行调研。同时，结合东莞实际，参考北京、广州等地对驻外机构的管理做法，拟出了《东莞市关于外地政府驻莞办事机构的管理规定》（征求意见稿），并在市公安局、工商局、劳动局、莞城街道等单位以及外地驻莞办事机构中广泛征求意见,多次修改，经市政府审定后，12月正式出台。

　　【发挥驻莞机构的协调作用】2003年，在突发“非典”期间，市政府经协办积极行动，采用文件、电话、会议等形式在外地驻莞办事机构中及时传达东莞市委、市政府的精神，做好宣传动员工作，并与各办事机构在《东莞日报》发出联名公开信，呼吁所属地的民工安心工作，有效地促进了政府与劳工的沟通联系。另外，还及时与广州市协作办联系，掌握外省政府驻穗办事机构的联系资料，较好地协调处理了大岭山镇政府反映的“河南飞越明珠歌舞团”56名演职人员经过检查排除非典型肺炎可能后，强烈要求返乡的突发事件。

　　【推动与内地协作和交流】为加强与内地的经济交流，2003年，市政府经协办组团赴山东菏泽参加了首届中国（菏泽）林产品交易会，赴青海西宁参加了“2003年（青海）第四届中国东部企业参与西部结构调整投资贸易洽谈会”以及四川成都的“2003年第四届中国西部国际博览会”、广西南宁的“2003年广西投资贸易洽谈会”等，并协助大京九成员城市河源市在东莞举行推介河源旅游资源工作会议及各项活动。2003年，市政府经协办接待了内地经济及扶贫考察团共87批1346人次。