1999年1月5日~1月7日，铁道部鉴定中心和省建委联合审查鉴定会在惠召开。批准惠澳铁路扩大初步设计。按改变后的设计，在惠州站接京九铁路，设惠环、三栋、莲塘、惠阳、澳头5个站，路长50.58公里，总投资7.77亿元。