至2015年底，全市污水管网缺口5938千米，待正本清源改造小区15500个，污水处理能力缺口143万吨/日，排水能力与超大型城市极其不匹配。全市共有黑臭水体159个，数量居全国36个重点城市之首，另有“河、湖、涵、沟、渠、塘”等小微黑臭水体1467个。

　　2015年底，深圳市委市政府审议通过《深圳市治水提质工作计划（2015-2020年）》，明确了“一年初见成效、三年消除黑涝、五年全面达标、八年让碧水和蓝天共同成为深圳靓丽的城市名片”这一目标体系。

　　2016年以来，建成污水管网6275千米，完成小区、城中村正本清源改造13650个，新增污水处理能力290万吨/日，总能力达到748万吨/日，完成138个水体的补水工程，加快推进调蓄池建设，建成18座、规模76.6万方，在建32座、规模103万方，初步形成初期污染雨水收集、调蓄、处理系统。依法依规全部处置一级水源保护区1069栋违建，强力拆除黑臭水体沿河违建134万平方米。截至2020年底，治水投资约1500亿。

　　经过5年努力，深圳补齐了建市40年来的水环境设施历史欠账，目前河流考核断面全部达标，并在全国率先实现全市域消除黑臭水体，入选为全国黑臭水体治理示范城市。