1998年度科技进步奖评奖是珠海市实行科技进步奖励制度以来的第十三次。1999年1月11日，在《珠海特区报》公告受理科技进步奖申报，至3月底，全市有31项科技成果向市科技进步奖评审委员会提出申请。市科技进步奖评委会根据科技进步奖奖励办法，以申报项目的技术水平、技术难度、科学性和实用性、所产生的经济和社会效益，以及对推动科技进步的作用大小为标准组织专家评审，以专家无记名打分和评委无记名投票的方式评出奖励项目和奖励等级。评审结果在《珠海特区报》公告一个月。公告期内收到两封异议信，都得到妥善处理。市科技进步奖评委会确定17个项目授予1998年度珠海市科技进步奖。其中二等奖7项，三等奖10项。

1999年6月30日，在市府综合楼会议室举行珠海市1998年度科技进步奖励大会，市委书记、市长黄龙云及市五套班子领导、广东省科委党组成员周兆龙，获奖人员、市直机关和企业领导、科技人员350多人参加了大会。副市长余荣霭作评审工作报告。

在1999年的科技进步奖评审中，实行产业政策倾斜。一是优先鼓励高新技术产品项目，以电脑软件系统和机电一体化项目为评审重点。在获奖项目中，电脑软件系统相关项目占1/3，如亿达科技电子公司的“感应式IC卡公交收费及计算机管理网络集成系统”、同望公司的“同望公路工程造价管理系统”、易初电子公司的“EASYCONBSTM银行综合业务网络系统”等。这反映出软件产业是珠海市今后发展的一个重要产业。二是大力推进农业科技进步，鼓励种植及养殖，品种改良以及新品种、新技术的引进、示范、普及和推广。依靠科技进步，发展“三高”农业，是现代农业的出路所在。在科技进步奖评审中把农业项目作为重点，评审出获奖项目3个，也是近年来少见的，体现市政府对农业科技进步的重视和支持。珠海市园艺所研究的“扶郎花种质资源库的建立及其生产、繁殖特性的研究”，收集了52个扶郎花品种进行提纯复壮，进行规模化示范种植，并成为中国扶郎花品种资源最齐全的生产基地。

科技进步奖对珠海市的经济建设和社会发展起到良好的推动作用。据对获奖项目中可直接计算经济效益的10个项目的不完全统计，在实施一年的时间里，销售收入为1.33亿元，创利税1376万元。

1999年珠海市有两项科技成果获1998年度国家科技进步奖，两项科技成果获得1998年度广东省科技进步奖，3项科技成果获1999年度国家科技进步奖。

珠海市科技进步奖评审委员会成员和科技重奖评审委员会成员实行两年任期制，1998—1999年度的评委任期届满，1999年10月14日市人民政府办公室下文，正式确定2000—2001年度珠海市科技进步奖评审委员会成员19人，评委会专家组成员81人，这些评委和专家都由各行业主管部门的推荐确定。1999年11月25日市人民政府办公室下文，正式确定珠海市推动科技进步奖励评审委员会成员由市人民政府和有关部委办负责科技方面工作的负责人16人组成。