积极探索、开拓创新，新型农村合作医疗工作迈上新台阶。参合率不断提高，2006年为88%，2007年达到93.8%，参加人数达到218229人，低保对象参合率为100%。合作医疗筹资水平不断提高。筹资标准2006年为每人每年60元（斗门区）或80元（金湾区）。住院补偿封顶线为6000元。有7961人次享受到住院补偿，补偿总金额824.26万元，其中184人次报销达到封顶线。农村未成年人可同时参加未成年人医疗保障制度和新型农村合作医疗。特困人员的基本医疗需求得到有效保障，全年筹集救助基金59.99万元，78名人次报销31.8万元。各级财政扶持资金得到有效保障，2006年市、区、镇三级财政共安排农村合作医疗补助资金到位总额725.56万元。农村合作医疗信息化管理得到完善。2006年香洲区建立征地居民合作医疗制度，参保率达到94.1%，人均筹资额为105元，报销封顶线达到7000元。